Do zakresu działania Biura Funduszy Europejskich należy w szczególności:

1. wskazywanie biurom i jednostkom organizacyjnym m.st. Warszawy finansowych i organizacyjno-prawnych możliwości zapewnienia środków z funduszy europejskich na realizację projektów związanych z zadaniami własnymi i polityki rozwoju m.st. Warszawy;
2. informowanie i prowadzenie działań edukacyjnych dotyczących rozwoju zdolności administracyjnych biur i jednostek organizacyjnych m.st. Warszawy w zakresie pozyskiwania środków z funduszy europejskich na realizację zadań własnych i polityki rozwoju m.st. Warszawy;
3. nadzór nad procesem przygotowania wniosków o dofinansowanie projektów ze środków europejskich, o których mowa w pkt 1;
4. prowadzenie zbiorczej ewidencji projektów realizowanych przez biura, jednostki organizacyjne m.st. Warszawy i osoby prawne m.st. Warszawy, które korzystają z finansowania w ramach określonych środków funduszy europejskich;
5. współpraca z jednostkami organizacyjnymi m.st. Warszawy i osobami prawnymi m.st. Warszawy w celu wykorzystania środków funduszy europejskich;
6. nadzór nad projektami realizowanymi przez biura i jednostki organizacyjne m.st. Warszawy,  finansowanymi ze środków funduszy europejskich;
7. realizacja zadań beneficjenta funduszy europejskich dla wybranych projektów inwestycyjnych i społecznych, w tym projektów interdyscyplinarnych i projektów międzynarodowych, realizowanych w Urzędzie;
8. udział w przygotowaniu planów inwestycyjnych m.st. Warszawy, w szczególności
   w zakresie identyfikacji projektów współfinansowanych lub planowanych do współfinansowania ze środków funduszy europejskich;
9. organizacja procesu naboru partnerów oraz rejestracja umów partnerskich tworzonych na potrzeby projektów współfinansowanych ze środków funduszy europejskich;
10. współpraca przy realizacji polityki gospodarczej i innowacyjnej m.st. Warszawy, w szczególności współpraca ze środowiskami gospodarczymi i naukowymi;
11. przygotowanie i realizacja projektów dotyczących rozwoju przedsiębiorczości i podnoszenia konkurencyjności gospodarki m.st. Warszawy.